Ved nationalsmuseets udgravning i 1953 og ved udgravningen omkring Højby sø's
Genetablering i 1990 - 1992 viste det sig at borganlægget Borren er fra den tidligere middelalder omkring år 1100.
Borgtårnet hvis fundament stadig kan ses, er bygget som forsvarstårn i de urolige tider, der fulgte efter mordet på Knud Lavard i 1137 hvor stormændene måtte hytte sig selv og sine familier i det borgerkrigshærgede land.
Formentlig er Borren en udflytning af en adelsgård fra Højby, til den forsvarsmæssige bedre beliggende halvø i Højby sø.
Borre har sandsynligvis været befæstet indtil Kong Valdemar fik eneherredømme i 1157.
Den kan herefter have været beboet uden at have betydning som privat forsvarsværk.
En anden mulighed kan have været at Borren på Kong Valdemars foranledning er blevet revet ned, mod at borgherren fik tildelt en anden gård i området.
Da Kong Valdemar kom til magten, passede det ikke kongen at der lå private småborge, spredt rundt om i landet.